Например, несколько лет назад(,) если прибыль направлялась на инвестиции в производство (буквально — на модернизацию), то налог начислялся лишь на её половину.
Спасибо!
UPD. Запятая — нужна.
Из дополнительного:
а. Чтобы фраза имела более гармоничный вид и подчинялась логике русского языка, следует выкинуть «то».
б. Слово «например» можно поставить перед «если», тогда запятая будет стоят без всяких вопросов, а фраза станет чуть менее косноязычной.